要控制沙门氏菌，了解鸡只通过何种途径被沙门氏菌感染十分重要，切断沙门氏菌的传播途径是控制沙门氏菌的最有效的手段之一，目前认为一般感染方式有以下几种：
1、由种鸡通过受精蛋垂直或经卵传播给雏鸡。这是鸡白痢、禽伤寒和肠炎沙门氏菌传播的主要途径。
2、沙门氏菌也会非垂直性经卵传播，当蛋壳表面受沙门氏菌污染时，沙门氏菌会通过蛋壳进入蛋内，感染发育的鸡胚，在出雏时，沙门氏菌再传播给其他鸡只。
3、沙门氏菌第三种传播方式是通过中间宿主或病菌携带者，将沙门氏菌从一个鸡群传播到另一个鸡群。传播者可为阳性鸡舍内的甲虫、苍蝇和老鼠，调查发现，在SE感染的蛋鸡群，老鼠是主要的病原菌传播者。
4、沙门氏菌的第四种传播方式是横向传播。横向传播，为任何有可能携带沙门氏菌的物体被至于鸡群之中，这些包括：饮水、垫料、被污染的日用品和饲料等。从目前的数据来看，饮水很少成为传播源，但水源被污染将不堪设想。饲料是主要的威胁，研究表明动物蛋白更容易受到污染，而植物蛋白，例如豆粕，很少受到污染。颗粒料和为减少或消除沙门氏菌而用化学方法处理的饲料，也能减少沙门氏菌污染的风险。