相对于传统的方法（抗生素、杀菌剂）而言，利用特异性针对致病菌的噬菌体对致病菌引起的病患进行防治的生物方法具有明显的优势。噬菌体在抗菌治疗领域有比传统抗生素所不具备的优势：
噬菌体具有严格的宿主特异性，只针对相应的病原菌，而不会破坏正常菌群。
噬菌体的作用机制与抗生素完全不同，细菌不易对噬体产生抗性。
噬菌体是宿主菌依赖性的，只在细菌感染部位发生作用，随着宿主菌的清除而死亡，不会残留在体内，因而更比抗生素具安全性。
噬菌体的指数增殖能力是噬菌体治疗的一个显着优势。在适当的条件下，一个裂解周期内，每个噬菌体会产生几百个子代噬菌体。因此用少量的噬菌体制剂就可以杀灭细菌。
噬菌体治疗的副作用少。
由于对于噬菌体在致病菌治疗中应用的研究刚刚起步，尽管噬菌体治疗细菌感染有诸多优势，但也存在很多局限性。例如，噬菌体携带某些毒素基因，弧菌会产生对抗噬菌体感染的突变株等。因此通过利用分子生物学方法对噬菌体进行改造后，可以剔除其毒素基因；严格筛选噬菌体，把不同感染策略的噬菌体混合，以避免弧菌突变株对单一感染策略噬菌体的抗性。该研究对于实现噬菌体制剂应用以解决致病菌的耐药性问题具有重大意义。

噬菌体是一类病毒，因其感染原核生物，又叫做细菌病毒。早在 1915 年 及 1917年，英国着名的细菌学家 Twort与法国的Herrlle分别发现了噬菌体的存在。噬菌体发现之初，科学家们便意识到其在细菌性疾病防治方面的应用价值，故做了大量试验研究其生物学特性。随着抗生素的出现，其研究被中断。当前耐药菌株不断出现及人们生物安全观念不断深化，噬菌体在细菌疾病方面的应用价值被重新重视起来，学者们又投入到对噬菌体的研究中，期望通过对其深入的研究，更好地应用于细菌疾病的治疗与预防。
一般认为噬菌体是生态友好型的，因为它们是从环境中分离出来的；同时由于噬菌体是作用于特定宿主细菌的，也不会杀死其他维持微生物平衡所需的无害细菌(Almeida et al., 2009)。噬菌体疗法在水产养殖病原生物防治方面引起了广泛的关注，许多学者将噬菌体疗法作为防治虾类荧光弧菌的一种重要手段(Surekhamol et al., 2014; Choudhury et al., 2017)。噬菌体的指数增殖能力是噬菌体治疗的突出优势。重复感染４个周期后，1个噬菌体颗粒可杀死数10亿个细菌，因此，少量的噬菌体制剂就可以杀死细菌。在使用噬菌体进行治疗时遇到的一个重要问题是细菌对噬菌体感染的抗性，尽管这个问题可以通过使用噬菌体鸡尾酒复合制剂来解决(Chan et al., 2013)。虽然目前对于细菌的抗噬菌体机制尚未研究清楚，但是研发噬菌体制剂所需要的时间短，仍然可以投入使用。因此，利用噬菌体制剂替代抗生素对“弧菌病”进行防控，可以有效解决抗生素耐药性带来的问题。
通过噬菌体复合制剂对养殖环境中耐受抗生素的条件性致病菌进行杀灭，对于水产养殖病害的防治、有效减缓超级细菌的产生以及探究除抗生素以外的细菌杀灭制剂具有重要意义。